در دانشگاه غیر انتفاعی :

درآمدها شامل بخشی دو بخش است:

1-  واریزهای وزارت علوم برای وام شهریه دانشجویان می باشد و بخشی برای تغذیه 

2- درآمدهای شهریه 

شیوه ثبت درآمدهابر اساس روشهای انتخابی نقدی یا نیمه تعهدی و .. شناسایی و ثبت می شود.

برای سیستم شهریه نرم افزارهای مستقلی برای بخش مالی دانشجویی در نظر گرفته میشود مثل نرم افزار ناد - گلستان و... که بصورت ماهیانه نسبت به انتقال و ثبت در سیستم حسابداری اقدام می شود.

طبقه بندی درآمدها بر حسب رشته - مقطع - سال ورود و نیمسالها تفکیک می شود.

در طبقه بندی هزینه ها نیز بر اساس چارت سازمانی و نظرات روسا دانشگاه نسبت به ثبت آن اقدام می شود.

در کنترل بودجه هم نرم افزارهای مرتبط با حسابداری که لینک باشند تهیه و استفاده می شود.

بقیه قسمتهای حسابداری آن فرقی با حسابداری شرکتها ندارد.(حسابداری انبار- حقوق و دستمزدو...)

در بخش محاسبات مربوط به دستمزد اساتید حق الزحمه ها نحوه بستن قراردادها مقداری متفاوت می باشد